3065 sayılı KDV Kanununun 17/4-ö maddesi ile, "Gümrük antrepoları ve geçici depolama yerleri ile gümrük hizmetlerinin verildiği gümrüklü sahalarda, ithalat ve ihracat işlemlerine konu mallar ile transit rejim kapsamında işlem gören mallar için verilen ardiye, depolama ve terminal hizmetleri"nin KDV'den istisna edildiğinden bahisle, yapılan denetim ve sonradan kontrol işlemlerinde ardiye faturaları incelenerek ardiye ücretlerinin eksik beyan edildiğinden hareketle KDV farkı ve ceza uygulandığı belirtilerek genel olarak uygulamada karşılaşılan sorunlara yer verilmekte, söz konusu sorunların çözümü için de, antrepolarda ya da geçici depolama yerlerinde beyanname tescil tarihine kadar KDV'siz, tescil tarihinden sonraki günler için KDV'li ardiye faturası kesilmesi yönünde bir düzenleme yapılmasının uygun olacağının mütalaa edildiği belirtilmektedir.
Bilindiği üzere, 3065 sayılı KDV Kanununun 21/c maddesi uyarınca, "gümrük beyannamesinin tescil tarihine kadar yapılan diğer giderler ve ödemelerden vergilendirilmeyenler ile mal bedeli üzerinden hesaplanan fiyat farkı, kur farkı gibi ödemeler", ithalatta KDV matrahına dahil bulunmaktadır.
